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MIRA結(jié)合Cas12a快速檢測(cè)兒童呼吸道疾病

急性呼吸道感染是兒童常見(jiàn)的呼吸道疾病,通常由病毒引起。呼吸道合胞病毒(RSV)和呼吸道腺病毒(ADV)是引起兒童急性呼吸道感染的兩種常見(jiàn)病原體。輕度者可引起常見(jiàn)的感冒癥狀,如咳嗽和流鼻涕,而嚴(yán)重者可出現(xiàn)嚴(yán)重的并發(fā)癥,如肺炎和中耳炎。根據(jù)世界衛(wèi)生組織的建議,病原體的檢測(cè)需要具備快速、準(zhǔn)確、敏感、特異性的特點(diǎn),不應(yīng)依賴專門的技術(shù)人員或大型儀器。因此,開(kāi)發(fā)一種能夠滿足上述檢測(cè)要求的RSV和ADV的檢測(cè)方法尤為重要。

深圳兒童醫(yī)院兒科研究所的馬東禮主任課題組在《Scientific Reports》期刊上發(fā)表文章《A multiplex recombinase polymerase amplification assay combined with CRISPR/ Cas12a for the detection of respiratory syncytial virus and respiratory adenovirus》,影響因子4.6。

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研究概述

多酶恒溫快速核酸擴(kuò)增技術(shù)MIRACRISPR/Cas檢測(cè)系統(tǒng)相結(jié)合。通過(guò)設(shè)計(jì)MIRA引物和CRISPR rna(crRNAs),多序列比較,優(yōu)化反應(yīng)條件,并使用熒光數(shù)值檢測(cè)裝置,驗(yàn)證靈敏度和特異性。

并且qPCR結(jié)果作為比較對(duì)照,研究了160例臨床咽拭子樣本的檢測(cè)結(jié)果的一致性。

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(MIRA-CRISPR/Cas12a檢測(cè)法檢測(cè)步驟示意圖)


實(shí)驗(yàn)結(jié)果

1. MIRA-CRISPR/Cas12a檢測(cè)方法靈敏度和特異性

MIRA方法檢測(cè)中,使用RSV-F1/R1引物對(duì)從RSV、ADV、PIV、RhV、MP、CP、FluB、hMPV、FluA或RSV/ADV合并感染患者的咽拭子樣本中擴(kuò)增核酸。除RSV和ADV有擴(kuò)增條帶,其他結(jié)果均為陰性,說(shuō)明所選MIRA引物與檢測(cè)的其他8種病原體未發(fā)生交叉反應(yīng),且保守性良好。

隨后,使用無(wú)菌水對(duì)RSV和ADV重組質(zhì)粒進(jìn)行10倍梯度稀釋,對(duì)RSV和ADV的檢測(cè)限均為106copies/mL。

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1-10:分別為RSV、RSV/ADV合并感染患者咽拭子樣本以及其他呼吸道病原體樣本

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1-6:107102稀釋質(zhì)粒DNA;7:陰性對(duì)照)

2.與qPCR做對(duì)比

qPCR方法相比,RSV和ADV的檢出限均為103copies/mL。

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(qPCR檢測(cè)RSV和ADV的靈敏度

       MIRA-CRISPR方法更適合基層實(shí)驗(yàn)室,檢測(cè)時(shí)間短,操作簡(jiǎn)單,無(wú)需大型qPCR儀器即可完成實(shí)驗(yàn)操作。

3.臨床樣本對(duì)比

從急性呼吸道感染的兒童中采集咽拭子樣本160例。同時(shí)使用MIRA-CRISPR方法、qPCR方法進(jìn)行檢測(cè),并將結(jié)果與臨床試驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行比較。

qPCR方法相比,MIRA-CRISPR方法對(duì)RSV和ADV的敏感性分別為98.1%和91.4%,檢測(cè)特異性均為100%。Kappa值大于0.95,表明其一致性程度較高。

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MIRA-CRISPR方法對(duì)RSV和ADV的檢測(cè)具備快速、靈敏、特異性強(qiáng)的優(yōu)勢(shì)。它能及時(shí)準(zhǔn)確地檢測(cè)到病毒感染,更加適合于醫(yī)療資源匱乏的地區(qū)使用

(上述數(shù)據(jù)等信息均來(lái)源于原文,鏈接:http://ting-mei.com.cn/vip_doc/28304219.html)



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